货物运输保险主险赔款计算按全部损失和部分损失分别计算，具体说明如下：
一、全部损失
通常运输险保单为定值保单，全部损失应按保险金额全数赔偿。不定值保险，出险时保额低于实际价值的按保额赔偿；出险时保额高于实际保险价值的按实际价值赔偿。保险公司全额赔偿后，损余归保险公司。
二、部分损失
1、数量损失的计算公式为：
保险金额×损失件数（重量）
-------------------------- = 赔款
承保总件数（总重量）
例如，一批服装共100箱，保险金额60000美元，丢失5箱，赔款额应为：60000 × 5/100 = 3000（美元）
2、质量损失实际上是价值的贬低，知道贬值率即可计算。计算公式为：
保险金额×（货物完好价-受损后价值）
贬值率=------------------------------------
货物完好价
保险金额 × 贬值率 = 赔款
例如，一件玉雕工艺品完好价是5000元，由于碎了一个角，经检验定损后认为只值3000元。它的贬值率即是（5000-3000）/5000 =
40%；赔款=5000×40%=2000元。
3、损失为一个包装单位中的一部分，要按最小单位计算出短量或渗漏损失数量，再加上大单位短量、渗漏数量后，按每公斤保额计算赔付金额。