欧盟委员会于2008年通过的有关法案，决定将国际航空业纳入欧盟的碳排放交易体系（EUETS）中，该法案将于
根据欧盟规定，飞经欧盟的航空公司可免费获得的碳排放量比例为82%，其余排放量中的15%将由航空公司通过拍卖的方式获取，剩余的3%的排放量将被分配给高速成长中的航空公司以及行业后来者。规定称，2012年航空业的碳排放量总量不得超过2.12亿吨，从2013年起不得超过2.08亿吨。
据市场人士初步测算，从东京飞往伦敦的单程碳排放量超过200吨，这笔碳排放费用一旦被转嫁到乘客身上，经济舱票价就会上涨约40美元。根据国际航空协会此前测算，欧盟碳税将使航空业成本明年增加34亿欧元。由于欧盟设定的免费配额逐年递减，随着航空公司机队规模和航线网络的扩大，航空公司将要缴纳的航空碳税将逐年递增。
专家认为，欧盟强行向过境航班征收碳税违反了国际公约，且其具体征收标准设置并不科学，贸然执行会给全球航空业带来成本重压，可能导致其他国家和组织无序出台对应规则的混乱局面。据悉，美国、日本、新加坡等国及欧盟内部一些航空公司已明确表示，反对欧盟单边收取碳排放税的作法。
有分析认为，在欧盟地区，从1990年至2003年，航空业的废气排放量增长73%，增长量远远高于其他行业。预计到2012年，这一增速将达到150%，如不及时采取控制措施，航空业造成的污染将使其他行业的温室气体减排成果付诸东流。实际上，瑞典、芬兰和丹麦等欧盟成员国早在多年前就开始征收碳排放税，爱尔兰在2009年也加入了此行列。目前，法国政府正在极力推动本国立法。但英国曾表示反对。征收碳税是为了有效地降低大气中的二氧化碳排放量，达到节能减排、净化环境的目的。然而欧盟对航空业起征碳税究竟能降低多少碳排放量，迄今为止没有任何公开的数据能够解释清楚。
专家指出，航空业的碳排放占到全球二氧化碳排放总量的3％，而其他行业，如冶金、电力、制造业等要比航空业高得多。因此有专家质疑，欧盟起征航空碳税的真正目的是醉翁之意不在酒。保护环境无可厚非，但是欧盟最根本的目的除了实现经济利益之外，也在利用环保来争夺全球话语权。首先，欧盟在政治上寻求对话是通过环保。第二，欧盟现在通过这种制度是在贸易方面加大新的制衡手段，加大欧盟的绿色技术出口能力。欧盟所说的清洁能源的产品系列很广。比如，航空器的制造技术，将来甚至是其他领域的清洁能源产品，欧盟都可能会提出相应的交换。
航空碳税的影响还可能触及到商业贸易领域。由于碳税课征或将导致运输成本提升，商贸领域的企业可能为此需���承担更多的开销。专家表示，欧盟这一举动表面上是针对航空业，但起到的实质效果却无异于在跨境服务贸易领域设置了碳关税壁垒。这样成本增加就会沿着产业链转移到货物贸易领域，那时候的影响就绝不仅是机票价格问题了，而是外贸企业的利润进一步收窄和生存空间受到挤压。
世界旅游业理事会总裁兼CEO大卫·斯克斯尔在接受媒体采访时说，他反对征收航空旅客税和欧盟碳排放税。“航空业对环境的影响经常被作为征收这类税的理由，然而却没有任何证据表明该项税收被用来弥补对环境的不良影响。”
众所周知，目前地球环境的破坏，全球气候的变暖，碳排放量的增加是西方发达国家近两百年工业化进程和现代社会发展所造成的直接结果。是西方发达国家追求更高生活品质所大量消耗各种能源、资源和原材料的结果。发展中国家也有追求同样的生活品质的权利，而其工业化进程才刚刚开始，最多也就是几十年的历史。如果要由发展中国家来承担全球气候变暖、碳排放量增加的责任，这显然是不公平的。